Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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