Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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