Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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