Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms