Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms