Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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