Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTMR3Q13615 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTMR3Q13615 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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