Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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