Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms