Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms