Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXF1Q12946 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXF1Q12946 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXF1Q12946 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXF1Q12946 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXF1Q12946 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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FOXF1Q12946 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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FOXF1Q12946 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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FOXF1Q12946 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXF1Q12946 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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FOXF1Q12946 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF1Q12946 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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