Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.1 ms