Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms