Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms