Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD47Q08722 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms