Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms