Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CXCL9Q07325 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms