Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms