Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms