Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms