Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRG1Q02297 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms