Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPCQ01831 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPCQ01831 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms