Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAT1AQ00266 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms