Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms