Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2P78314 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms