Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms