Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms