Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms