Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN8P56748 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms