Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CLDN15P56746 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLDN15P56746 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLDN15P56746 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLDN15P56746 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLDN15P56746 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLDN15P56746 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLDN15P56746 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLDN15P56746 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLDN15P56746 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLDN15P56746 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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