Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1P52655 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms