Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGS4P49798 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGS4P49798 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGS4P49798 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGS4P49798 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGS4P49798 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGS4P49798 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGS4P49798 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGS4P49798 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGS4P49798 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms