Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP4P49662 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP4P49662 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP4P49662 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP4P49662 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP4P49662 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP4P49662 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms