Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NESP48681 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NESP48681 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NESP48681 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NESP48681 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NESP48681 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NESP48681 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms