Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF5P43026 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF5P43026 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF5P43026 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF5P43026 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms