Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms