Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGCXP38435 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGCXP38435 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGCXP38435 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms