Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LTBRP36941 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
LTBRP36941 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms