Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms