Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms