Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms