Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR1EP28566 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms