Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms