Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPREP23469 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPREP23469 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPREP23469 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPREP23469 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms