Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGFR3P22607 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms