Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP4AP20648 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP4AP20648 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms