Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms