Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD53P19397 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms