Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms