Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3P10147 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3P10147 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3P10147 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3P10147 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms